El segundo título de la temporada fue el de Copa del Rey, en el que se impusieron en la final al Real Madrid, camisetas barcelona que disputaba como anfitrión el torneo. En el primer torneo de la temporada, se alzaron con la Supercopa tras vencer en semifinales 89-55 al Real Madrid, siendo la victoria más abultada frente a los blancos en toda la historia, e imponiéndose al Valencia en la final. En la temporada 2012-13, los papeles se invertirían: el Fútbol Club Barcelona gana la Copa del Rey tras vencer al Valencia en la final (85-69) y eliminar al Real Madrid en cuartos, tras dos prórrogas (108-111). Pero el conjunto blanco se llevó la Supercopa y liga ACB al vencer al Barça en cinco partidos.
