Ya en su regreso, la temporada continua por buen camino, pero termina siendo eliminado de la Copa del Rey y la Liga de Campeones en semifinales. El 25 de abril de 2014 el exentrenador del club Tito Vilanova, fallece debido a su cancér en la ciudad de Barcelona. Setién obtuvo 16 victorias, cuatro empates y cinco derrotas en los siete meses en los que dirigió al equipo, siendo sustituido el 19 de agosto de 2020 por el neerlandés Ronald Koeman.
